SARS-CoV-2 XD, XE, XF 신종 재조합 변이

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"SARS-CoV-2 재조합 변종"


XD, XE, XF 3개의 SARS-CoV-2 재조합 하이브리드 변종은 2022년 3월 Pangolin에 의해 지정되었으며, XD와 XF는 Delta와 BA.1의 조합으로, XE는 Omicron BA.1 및 NSP3와 NSP12에 추가 돌연변이를 가진 Omicron BA.2의 조합으로 지정되었습니다.

바이러스 재조합은 코로나바이러스, HIV 및 인플루엔자를 포함한 많은 바이러스에서 발생합니다. 결과물은 무해하기도 하지만 잠재적으로 더 많은 감염성 비리온을 생성하기도 합니다. 바이러스의 재조합 현상은 두가지 바이러스 균주가 동일한 숙주세포를 감염시키고 복제중에 상호작용하여 두 원래 균주의 유전자를 포함하는 다른 균주를 생성하면서 발생합니다. 새로운 변종은 기존 백신과 치료법을 피하여 새롭고 예상치 못한 특성을 가질 수 있습니다.

아래는 UK Health Security Agency(UKHSA)에서 제공한 게놈 도식과 비교하여 recombinant lineage를 그래픽으로 표현한 테이블 입니다. 

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[참고] 팽고(Pango)는 코로나 19 바이러스의 계통(lineage)을 문자와 숫자로 시스템화하여 명명하는 시스템입니다. 예를 들어 B.1.1.7, B.1.617.2등과 같은 명칭을 생성하며, 그러한 계통을 관리하는 소프트웨어 이름을 팽골린(Pangolin)이라고 합니다. 팽고는 변이군의 돌연변이를 찾고 계통을 확인하는데 수월한 도구입니다. 


"SARS-CoV-2 XD, XE, XF"

XD는 Delta와 Omicron BA.1의 조합입니다. 

좀더 구체적으로 말하면, Delta AY.4와 Omicron BA.1 spike로 구성되어 있습니다.
두가지 다른 변이체의 재조합은 두 parent virus의 기능을 결합하여 어느 한쪽의 virus와는 다른 표현형 발현을 일으킬 수 있습니다. 이 경우, 잠재적으로 Omicron의 감염성과 Delta의 질병 중증도를 보일 수 있습니다. 
이 타입은 2021년 12월에 프랑스, 덴마크, 벨기에에서 처음 확인되었습니다.

XE는 Omicron BA.1과 BA.2의 조합입니다. 

이 변이체는 Omicron BA.1과 BA.2 계통의 조합으로 1월 19일 영국에서 처음 발견되었으며, 
UK Health Security Agency 보고서에 따르면 지금까지 600건 이상이 확인되었습니다. 이 변이는 BA.2의 spike 및 구조 단백질과 BA.1 게놈의 일부로 조합되었습니다. 

XF는 Delta와 Omicron BA.1의 재조합입니다. 

Delta의 NSP3 말단 근처 뉴클레오타이드 5386까지의 게놈과 Omicron BA.1의 조합으로 구성됩니다. 이 변종은 2022년 1월 7일에서 3월 14일 사이에 발견되었으며 영국에서만 발견되는 것으로 보입니다. 

이러한 재조합 변이체들이 공중 보건 문제를 일으킬지 여부를 판단하기에는 너무 이르지만, 바이러스는 항상 재조합되기 때문에 신중하게 지켜봐야 합니다.




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