CUTANA CUT&RUN Assay는 적은 샘플로도 ChIP 시퀀싱이 가능합니다.




ChIP-Seq은 타겟단백질이 결합된 크로마틴 부위를 침전시켜 농축하고 그 시퀀스를 NGS로 분석하는 기술입니다. 그러나 ChIP-Seq은 세포의 양이 적은 샘플의 경우 DNA를 얻기 힘들고, 노이즈 백그라운드가 높다는 한계를 갖고 있습니다. 

이에 반해 CUT&RUN 시퀀싱은 온전한 세포로부터 타겟 단백질만을 잘라내는 방식으로, ChIP-Seq에 비해 적은 수의 cell로도 분석이 가능하고, 시간이 단축되며, signal to noise ratio가 월등히 향상되어 Chromatin NGS에 효과적으로 이용될 수 있는 툴 입니다. 


CUTANA™ CUT&RUN Assays

  • 높은 민감도 (5000-500,000 cells)
  • Experimental control 제공
  • pAG-MNase로 타겟 fragmentation
  • Spike-In DNA control 제공

[ Workflow ]
  1. Magnetic bead에 cell 고정
  2. 타겟 DNA에 결합되어 있는 단백질에 대한 항체 처리
  3. pAG-MNase로 타겟 nucleosome 컷팅
  4. CaCl2+로 nucleosome complex 유리 및 분리
  5. DNA 추출 및 library prep
  6. NGS 진행


CUTANA™ CUT&Tag Assays

  • 높은 민감도 (1000-100,000 cells)
  • Cell에서 DNA까지 하나의 tube에서 진행
  • Library prep 과정이 생략되어 시간 절감
  • ChIP-seq 대비 3배 이상 비용 절감


[ Workflow ]
  1. Magnetic bead에 nuclei 고정
  2. 타겟 DNA에 결합되어 있는 단백질에 대한 항체 처리
  3. pAG-Tn5로 타겟을 분리하고 sequencing adapter 부착
  4. PCR 후 DNA 추출하고 시퀀싱 바코드 adapter 부착
  5. NGS 진행


Epicypher 제품 문의 : 고마바이오텍(주) (02-579-8787)