더욱 향상된 새버전 CUT&Tag 출시! 무엇이 달라졌을까?

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  CUT&Tag 기술은 항체로 표지된 chromatin이 Tn5 transpose와 Protein AG에 의해 선택적으로 절단되고 시퀀싱 어댑터가 태깅되면서 반응 혼합물에서 직접 증폭되어 (Direct-to-PCR) 라이브러리 필요없이 높은 민감도로 크로마틴 시퀀싱을 진행할 수 있는 방법으로, PTM 매핑에 권장됩니다.  EpiCypher의 CUT&Tag Kit은 세포에서 정제된 시퀀싱 라이브러리 준비에 필요한 모든 시약을 제공합니다. 최근 출시된 Version 2 제품은 프로토콜과 버퍼구성을 최적화하여 샘플 소실을 최소화합니다.  CUT&Tag이 왜 필요한가요? 기존의 ChIP 기술로는 불가능한 단순화된 workflow가 필요할 때, High throughput 크로마틴 매핑 분석이 필요할 때, 세포수가 적을 때, 더 높은 해상도의 데이터가 필요할 때 유용합니다.  CUT&Tag이 ChIP-seq이나 CUT&RUN에 비해 훨씬 빠른 이유는 무엇인가요? 세포 용해, 염색질 단편화 과정 없이 천연 세포에서 15분 안에 핵을 수확하여 자성 ConA 비드와 자석 랙을 통해 신속하게 세척과정을 수행할 수 있고, 시퀀싱 어댑터를 직접 추가함으로써 표준 라이브러리를 만들 필요가 없어 샘플 손실이 줄어듭니다. 8 strip tube에서 PCR mix와 indexing primer, tagmented DNA를 바로 증폭할 수 있어 시간이 단축되므로, 시간에 민감한 프로젝트의 경우 효과적입니다. ChIP-seq에 비해 CUT&Tag에서 더 적은 수의 셀을 사용할 수 있는 이유는 무엇인가요? ChIP-seq에서는 input 염색질을 준비하려면 cross-linking, chromatin sonication 이나 fragmentation이 필요하고, IP 단계에서 단편화된 염색질 pool에 항체가 추가됩니다. 항체가 표적에만 결합해야 하지만 IP 방법은 항상 off-target fragment를 생성하여, 시퀀싱에서 높은 백그라운드와

[NETRI] Chemotherapy에 의한 말초신경병증 온칩 모델: "구획화"의 강점

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요약 • 독성 말초 신경병증 연구를 위한 human sensory neurons-on-chip • 구획화 및 유체 격리를 이용한 신경독성의 작용 방식과 메커니즘 구별 : soma vs. neurites • 치료 접근 방법 결정 : 국소 치료 방식 vs. 전신 치료 방식 • High-Throughput Assays 및 MicroElectrode Array(MEA)와 호환되는 플랫폼 개요 통증에는 여러가지 병인이 있으며 nociceptive pain ( 침해성 통증; 조직 손상으로 인한 통증) 과 neuropathic pain  (신경병성 통증; 체성감각 신경계의 손상으로 인한 통증)으로 분류할 수 있습니다. Chemotherapy로 인한 말초신경병증성 통증은 치료 과정 중 60-80%의 환자들에게 영향을 미칩니다. 20-40%의 환자에게는 치료 후에도 만성적인 통증이 지속될 수 있어 환자의 삶의 질에 큰 영향을 미칩니다.  Chemotherapy agents는 신경병증의 발병률에 따라 백금 화합물 (oxaliplatin 등), taxanes (paclitaxel 등), 면역조절제, epothilones, proteasomes 억제제, 그리고 vinca alkaloids와 같이 크게 6가지 카테고리로 나뉩니다 [1,2]. 감각 말초 신경병증의 증상에는 손과 발에서의 마비, 특히 “바늘이 박힌 듯한” 감각과 손발의 이상감각 및 저림이 있습니다. 통증을 관리하는 방법은 제한적이며 효과가 충분하지 않은데 [2,3], 이는 관련 연구 모델의 부족으로 일부 설명될 수 있습니다. 현재 동물 기반 in vivo 모델은 translationability가 부족하고 발생된 통증에 대해서만 실험할 수 있으며, in vitro assay는 작용 메커니즘과 독성을 이해하기에는 해부학적 관련성과 복잡성이 부족합니다 [4,5]. 통증 신호는 주로 감각 뉴런의 자유 신경 말단에 의해 감지되고, axon을 통해 dorsal root ganglia (등근 신경절)의 세포체로 전달된 다음 do

[웨비나] CNS약물의 Reposition과 대사증후군 MASH 치료제의 Approcah (종료)

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Eurofins Discovery사의 전문가를 통해 CNS약물의 Reposition과 대사증후군 치료제의 작용기전에 도움이되는 MASH 치료제 연구에 대해 소개해 드리는 시간을 갖습니다. 주제:         1. Drug Reposition: Another Possibility for CNS Drug Discovery        2.  Metabolic Syndrome Challenge: A Comprehensive Approach 일시 :  2024년 3월 28일(목), 오후 2시 (약 40분) 연자 :  Chun-Yao Ph.D (Eurofins Discovery / Lab Director) 방법 :  신청해 주신 분들께 온라인 ZOOM 웨비나 접속 링크를 보내드립니다.    이 웨비나는 종료되었습니다. 문의 : 고마바이오텍(주) (02-579-8787)

[웨비나] HepaRG의 fibrosis, 3D spheroid 형성, 간독성평가에 대한 적용 (종료)

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HepaRG는 primary human hepatocyte와 동등한 기능과 활성을 발현하는 immortalized cell line으로, 신약후보물질의 ADME, Toxicity 분석 및 liver disease 연구에 이용됩니다.  HepaRG cell 보러가기 Biopredic은 2월 15일 한국시간 오후 6시-8시에 (프랑스시간 오전 10-12시) 섬유증(fibrosis)과 3D 및 MPS hepaRG 기반 모델을 중심으로, HepaRG에 대한 웹 세미나를 진행합니다.  일시 : 2024/2/15 (목) 오후 18시 - 20시 (한국시간) 주관 : Biopredic (프랑스)  방법 : 등록하기 접수 (온라인 접속 링크 제공) 내용 :  세션 1 (18:00pm - 18:40pm) : In vitro fibrosis 모델링을 위한 HepaRG™ 세포의 사용 세션 2 (18:40pm - 19:20pm) : HepaRG™ spheroid 형성 세션 3 (19:20pm - 20:00pm) : 3D HepaRG™ 기반 약물 유래 간 독성 평가 With our HepaRG™ cells,  WE provide the HepaRG™ EXPERTISE !    Join us for our upcoming webinar with three insightful sessions revolving around the HepaRG™ model. February 15th, 2023 at 10am-12pm CET    SESSION 1     The use of H

CUT&RUN 프로토콜

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CUT&RUN이란? CUT&RUN은 Cleavage Under Targets & Release Using Nuclease를 의미합니다. Lectin 단백질로 코팅된 magnetic ConA bead는 세포막이나 핵의 막에서 발견되는 당접합체(glycoconjugates)를 결합하는데 사용됩니다. 타겟(예, PTM)에 대한 항체는 막을 통과하여 타겟 염색질에 붙습니다. 다음으로 Protein AG micrococcal nuclease (pAG-MNase)가 첨가되는데, 이는 항체 결합 염색질에 결합합니다. 염화칼슘을 첨가하면 효소의 표적 복합제 절단이 활성화되어 세포밖으로 확산될 수 있습니다.  DNA는 상층액에서 수집되어 library 준비 전에 정제됩니다. 실험의 성공여부는 시퀀싱 코어 또는 벤치탑 sequencer를 사용하여 시퀀싱하기 전에 바이오분석기 추적을 통해 테스트됩니다. 결과가 나오면 통합 genome 브라우저 또는 적절한 시각화 도구를 사용하여 데이터를 분석하고 볼수 있습니다. EpiCypher의 CUT&RUN 프로토콜은 히스톤 PTMs, 전사 인자, 염색질 리모델러, Writer 및 Reader의 게놈 프로파일링을 위한 검증된 플랫폼을 제공합니다. 세포 타입 및 조건 CUT&RUN을 처음 사용하거나, 새로운 항체를 테스트하는 경우, 세포유형, 실험조건, 대조 및 항체를 신중하게 고려하는 것이 중요합니다. EpiCypher의 CUT&RUN 프로토콜은 다양한 세포 및 샘플 유형과 호환됩니다.  Histone PTMs 및 transcription factor를 프로파일링하는 경우, 부착 세포와 현탁 세포주, 조직 샘플 등, native cell 또는 고정되지 않은 세포가 이상적입니다. CUTANA CUT&RUN 프로토콜은 약하게 cross-linking된 cell에도 사용할 수 있습니다. 일시적인 염색질 상호작용과 histone PTMs의 특정 하위 집합을 프로파일링 하려면 샘플을 고정하는 것을 권장

[NETRI] Organ-on-Chip 웨비나에 초대합니다. (종료)

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NETRI는 제약, 피부 미용, health에 적용되는 장기 칩(organs-on-chip)을 개발합니다. 동일한 organ 또는 다른 organ의 서로 다른 영역의 생리적 행동, 조직간의 상호 작용 또는 복잡한 신경 네트워크를 NETRI 단일 칩에서 재현할 수 있습니다.(예: 감각 뉴런과 피부세포의 공동 배양으로 신경이 분포된 피부 재현, 또는 뉴런과 근육 세포의 공동 배양을 통한 ALS 환경 재현 등..) 이번 웨비나에서는 NETRI의 organ-on-chip의 기술적인 특징과, 신경 및 통증 연구에 적용한 사례를 통해 동물실험 대체 플랫폼으로서의 장점과 유용성을 검토할 수 있는 시간을 마련하였습니다. 많은 관심 부탁드립니다. 주제:  NETRI Organ-on-Chip의 신경 및 통증 연구 적용 1) NETRI Organ-on-chip 기술 안내 2) Pain & Injury, CIPN, Neurodegenerative disorder 연구에서의 응용사례  일시 :  2024 년  1 월  31 일  (수 ),  오후 4 시  - 5시 연자 :  NETRI Tech team  방법 :  신청해 주신 분들께 온라인 ZOOM 웨비나 접속 링크를 보내드립니다.    종료 문의 : 고마바이오텍(주) (02-579-8787) * 관련 제품 NETRI Microfluidic chip Sensory Neuron 한눈에 보는 Cell 선택가이드

NETRI 미세유체 장치를 이용한 인간 신경네트워크 복제

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전임상 단계에서 유망하다고 간주된 약물이 초기 임상 개발 단계에서 실패하는 데에는 수많은 이유가 있지만, 인간 환자 시험에서 효능이 부족하거나 예상치 못한 독성이 가장 일반적입니다. 이는 정상 및 질병 표현형을 더 잘 재현하고, 인간 생리학의 주요 측면의 복제율을 높여 관련성이 높은 분석 및 모델을 만들기 위한 노력으로 이어지고 있고, 대조군과 환자 샘플의 인간 유도 만능 줄기 세포에서 추출한 세포와 같은 인간 세포를 이러한 분석에 사용함으로써 임상 시험으로 진행하기 전에 더 나은 분류 치료법을 기대할 수 있습니다. NETRI OoC 미세유체 장치의 특징 NETRI는 혁신적인 Organ-on-Chip(OoC) 분석의 형태로 이러한 분석을 설계, 제조 및 제공하는 회사입니다. OoC는 미세유체 장치에서 배양된 인간 유래 세포를 결합하여 생명공학 및 제약 회사에 관련 모델을 제공합니다.  미세유체칩을 이용하면 손쉽고 빠르게 결과를 도출할 수 있고, 제약 및 규제 부분에서 In vitro 모델을 이용한 예측이 가능합니다.  NETRI 미세유체칩을 통한 실험을 다음과 같은 장점을 제공합니다.  1. 견고한 제작 공정과 각 단계에서의 품질 관리를 통해 재현성있는 실험 결과를 보장합니다. 2. 미세유체칩에서의 세포 배양 호환성이 뛰어납니다. 3. 제기되는 과학적인 질문에 특정한 Human cell을 활용하여 입증할 수 있습니다. 4. 직접 제조하여 정확하고 반복 가능한 아키텍처를 보장합니다. 5. in vitro에서 세포의 기능을 분석하여 고부가가치 성과를 창출할 수 있습니다. AXOL Sensory Neuron의 적용 관련 인간 생물학적 모델을 얻으려면 성숙하고 고도로 분화된 인간 유래 세포가 필요합니다. Axol사의 sensory neuron은 cDNA PCR을 통해 정량화된 고유 감각 및 통각과 관련된 주요 마커를 발현합니다. 이러한 데이터는 다양한 reference compounds, capsaicin이나 열에 대한 특정 전기 생리학적 반응을 나타내는 자극에 테스

[Eurofins Discovery] SPR 분석서비스 웨비나에 초대합니다. (종료)

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Surface Plasmon Resonance (SPR, 표면 플라즈몬 공명)은 분자간의 결합을 특성화 함으로서 신약개발 연구에 있어 신약 후보 물질의 특성을 정의하고 생물학적 유사성 평가에 필수적인 분석도구로 이용되고 있습니다.  Eurofins Discovery사에서는 Biacore 8K+ 시스템을 이용하여 항원-항체간의 결합, 이중항체 동시결합 분석, compound의 inhibition 효과 확인, 타겟에 대한 compound의 binding level 측정, 단백질 배양액의 정량, 분자간의 결합력분석 등 다양한 분자간의 상호작용을 분석해 드리고 있습니다.  이번 웨비나를 통해 SPR 분석서비스에 대한 자세한 설명과 Case study를 안내하는 시간을 갖고자 하오니 많은 참석 부탁드립니다.  주제:  SPR applications in drug discovery (신약개발에서의 SPR 적용) 일시 :  2023 년  12 월  4 일  ( 월 ),  오후 2 시   연자 :  Kai Lin Ph.D / Eurofins Panlabs Discovery Services 방법 :  신청해 주신 분들께 온라인 ZOOM 웨비나 접속 링크를 보내드립니다.    종료 문의 : 고마바이오텍(주) (02-579-8787)

바이러스 제작서비스 이벤트 (종료)

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바이러스 3개를 2개 가격으로 제작해 드립니다.  기간 : 2023년 11월 1일 - 12월 31일  LV, AAV, AV 바이러스 제작에 해당됩니다. 바이러스 교차 주문 가능합니다. Cloning과 QC 비용은 별도입니다. 문의 및 상담 : ejcha@komabiotech.co.kr AAV 제작서비스 바로가기 LV 제작서비스 바로가기 AV 제작서비스 바로가기  문의 : 고마바이오텍(주) (02-579-8787)

Cerebral Cortical Neurons, Interneuron, Astrocytes의 tri-culture 방법

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  1. 필요한 제품  Product code Description ax0015, ax0016, ax0018, ax0111, ax0112, ax0113, ax0114, ax0211, ax0411 Human iPSC-derived Cortical Neural Stem Cells (NSCs) ax0662, ax0667 Human iPSC-derived Cortical Inhibitory Interneuron Progenitors ax0665 Human iPSC-derived Astrocytes ax0031 Neural Maintenance Medium ax0033 Neural Plating Media ax0674 NeurOne Cortical Neuron Supplement ax139800 (10 mg) Recombinant BDNF ax0053 SureBond-XF ThermoFisher Scientific B-27 Supplement ThermoFisher Scientific Neurobasal™-A Media ThermoFisher Scientific GlutaMAX™ ThermoFisher Scientific 2-Mercaptoethanol (50 mM) Merck-Sigma Dibutyryl-cAMP Merck-Sigma Ascorbic